Здравствуйте, Вам необходимо обратиться к юристу для составления заявления - в двух словах заданные Вами вопросы, к сожалению, не описать, нужно вникать подробнее, чтобы помочь Вам.

Иск есть смысл подавать если вы заключили трудовой договор с реальной действующей организацией, а не с "фирмой-однодневкой", т.к. непонятно на основании чего вы подписали договор с одним ООО, а работали в другом ООО. В любом случае надо определиться какое ООО является надлежащим ответчиком и подавать в суд.

В соответствии со ст. 67 Трудового кодекса РФ трудовой договор, не оформленный в письменной форме, считается заключенным, если работник приступил к работе с ведома или по поручению работодателя или его уполномоченного на это представителя. При фактическом допущении работника к работе работодатель обязан оформить с ним трудовой договор в письменной форме не позднее трех рабочих дней со дня фактического допущения работника к работе, а если отношения, связанные с использованием личного труда, возникли на основании гражданско-правового договора, но впоследствии были признаны трудовыми отношениями, - не позднее трех рабочих дней со дня признания этих отношений трудовыми отношениями, если иное не установлено судом. Более того, на основании ст. 67.1. Трудового кодекса РФ - если физическое лицо было фактически допущено к работе работником, не уполномоченным на это работодателем, и работодатель или его уполномоченный на это представитель отказывается признать отношения, возникшие между лицом, фактически допущенным к работе, и данным работодателем, трудовыми отношениями (заключить с лицом, фактически допущенным к работе, трудовой договор), работодатель, в интересах которого была выполнена работа, обязан оплатить такому физическому лицу фактически отработанное им время (выполненную работу).